Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG13O75143 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG13O75143 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG13O75143 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG13O75143 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG13O75143 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG13O75143 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG13O75143 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG13O75143 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG13O75143 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG13O75143 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG13O75143 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG13O75143 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG13O75143 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG13O75143 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG13O75143 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG13O75143 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG13O75143 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG13O75143 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG13O75143 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG13O75143 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG13O75143 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG13O75143 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG13O75143 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG13O75143 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG13O75143 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG13O75143 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG13O75143 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG13O75143 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG13O75143 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG13O75143 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG13O75143 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG13O75143 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG13O75143 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG13O75143 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG13O75143 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG13O75143 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG13O75143 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG13O75143 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG13O75143 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG13O75143 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG13O75143 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG13O75143 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG13O75143 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG13O75143 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG13O75143 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG13O75143 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG13O75143 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG13O75143 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG13O75143 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG13O75143 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG13O75143 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG13O75143 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG13O75143 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG13O75143 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG13O75143 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG13O75143 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG13O75143 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG13O75143 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG13O75143 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG13O75143 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG13O75143 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG13O75143 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG13O75143 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG13O75143 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG13O75143 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG13O75143 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG13O75143 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG13O75143 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG13O75143 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG13O75143 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG13O75143 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG13O75143 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG13O75143 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG13O75143 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG13O75143 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG13O75143 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG13O75143 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG13O75143 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG13O75143 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG13O75143 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG13O75143 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG13O75143 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG13O75143 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG13O75143 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG13O75143 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG13O75143 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG13O75143 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG13O75143 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG13O75143 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG13O75143 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG13O75143 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG13O75143 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG13O75143 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG13O75143 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG13O75143 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG13O75143 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG13O75143 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG13O75143 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG13O75143 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms