Protein–RNA interactions for Protein: O75081

CBFA2T3, Protein CBFA2T3, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T3O75081 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBFA2T3O75081 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T3O75081 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms