Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8B3O60423 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP8B3O60423 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms