Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCA5O60264 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCA5O60264 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCA5O60264 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms