Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8B1O43520 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms