Protein–RNA interactions for Protein: O43396

TXNL1, Thioredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1O43396 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TXNL1O43396 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TXNL1O43396 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TXNL1O43396 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TXNL1O43396 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TXNL1O43396 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TXNL1O43396 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TXNL1O43396 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TXNL1O43396 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TXNL1O43396 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXNL1O43396 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNL1O43396 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms