Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGSM2O43147 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGSM2O43147 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms