Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PFDN6O15212 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN6O15212 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms