Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCF2LO15068 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCF2LO15068 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCF2LO15068 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms