Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPEO14579 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPEO14579 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPEO14579 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPEO14579 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPEO14579 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPEO14579 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPEO14579 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPEO14579 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COPEO14579 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPEO14579 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPEO14579 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPEO14579 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPEO14579 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPEO14579 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPEO14579 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COPEO14579 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPEO14579 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPEO14579 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPEO14579 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPEO14579 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPEO14579 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPEO14579 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPEO14579 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPEO14579 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPEO14579 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPEO14579 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPEO14579 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPEO14579 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPEO14579 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPEO14579 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPEO14579 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPEO14579 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COPEO14579 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPEO14579 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPEO14579 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPEO14579 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COPEO14579 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPEO14579 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPEO14579 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPEO14579 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPEO14579 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPEO14579 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPEO14579 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPEO14579 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPEO14579 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPEO14579 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPEO14579 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPEO14579 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPEO14579 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPEO14579 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPEO14579 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPEO14579 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPEO14579 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPEO14579 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPEO14579 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPEO14579 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPEO14579 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPEO14579 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPEO14579 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPEO14579 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPEO14579 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPEO14579 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPEO14579 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPEO14579 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPEO14579 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPEO14579 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COPEO14579 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPEO14579 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPEO14579 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPEO14579 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COPEO14579 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPEO14579 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPEO14579 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPEO14579 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPEO14579 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPEO14579 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPEO14579 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPEO14579 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPEO14579 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPEO14579 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPEO14579 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPEO14579 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPEO14579 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms