Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCR6O00574 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR6O00574 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms