Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF839A8K0R7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF839A8K0R7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms