Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms