Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV5S1A1TA0A578 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV5S1A1TA0A578 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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