Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCRBV7S3A2A0A539 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCRBV7S3A2A0A539 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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