Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFIP11Q9UBB9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms