Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG3Q9NT62 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms