Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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PFDN4Q9NQP4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
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PFDN4Q9NQP4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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PFDN4Q9NQP4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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PFDN4Q9NQP4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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PFDN4Q9NQP4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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