Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI1

IRX2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX2Q9BZI1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX2Q9BZI1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms