Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HECW1Q76N89 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms