Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LACTB2Q53H82 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms