Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC57Q2TAC2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC57Q2TAC2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC57Q2TAC2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC57Q2TAC2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC57Q2TAC2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC57Q2TAC2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC57Q2TAC2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC57Q2TAC2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC57Q2TAC2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC57Q2TAC2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC57Q2TAC2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC57Q2TAC2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms