Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
USF2Q15853 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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