Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PDCD1Q15116 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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