Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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