Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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