Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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