Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIF5AQ12840 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KIF5AQ12840 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms