Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN12Q05209 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN12Q05209 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms