Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UFM1P61960 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UFM1P61960 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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