Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NUP107P57740 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NUP107P57740 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NUP107P57740 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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NUP107P57740 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NUP107P57740 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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