Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJC1P36383 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJC1P36383 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms