Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXCR5P32302 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms