Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA13P31271 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms