Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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