Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PCH4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PCH4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PCH4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PCH4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms