Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF839A8K0R7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF839A8K0R7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms