Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMG5Q9UPR3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms