Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC23Q9UJX2 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms