Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG3Q9NT62 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms