Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms