Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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