Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms