Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms