Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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