Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TDRD12Q587J7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms