Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD4L6Q3SYB3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms