Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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