Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms