Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCL15Q16663 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL15Q16663 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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